O novo ministro do Ambiente foi administrador dos portos do Douro e Leixões, tendo uma extensa experiência em planeamento e transportes e também em funções académicas – lecionou como convidado em mestrados nas universidades do Porto, Técnica de Lisboa e de Nápoles. Matos Fernandes foi ainda administrador da Quartenaire Portugal, Consultoria para o Desenvolvimento SA, entre 1999 e 2005.
Da sua experiência política constam as funções de adjunto do secretário de Estado dos Recursos Naturais, entre 1995 e 1997, e de chefe de gabinete do secretário de Estado adjunto da ministra do Ambiente, Elisa Ferreira, entre 1997 e 1999 (no primeiro Governo de Guterres, em ambos os casos).
Matos Fernandes transita da Águas do Porto, a que preside desde janeiro de 2014, para o XXI Governo.